关键错误和MultiIndex lexsort深度


问题内容

我有一组制表符分隔的文件,必须阅读这些文件,将它们用作pandas数据框,对它们进行一堆操作,然后将它们合并回一个excel文件,代码太长,所以我要经历其中有问题的部分

我正在解析的选项卡文件包含所有相同数量的行2177

当我阅读这些文件时,我正在按类型(字符串,整数)的前两列进行索引

df = df.set_index(['id', 'coord'])
data = OrderedDict()
#data will contain all the information I am writing to excel
data[filename_id] = df

我正在执行的过程之一需要访问data [sample_id]的每一行,该行包含混合类型的数据帧,这些数据类型以“ id”和“ coord”列为索引,像这样

sample_row = data[sample].ix[index]

我的索引是(’id’,’coord’)

如果我正在处理文件的子集,那么一切都很好,但是如果我用2177行读取了整个文件,则最终会收到此错误消息

KeyError: 'Key length (2) was greater than MultiIndex lexsort depth (0)'

我在SO各处搜索了所有内容,似乎这是对索引进行排序的问题,但是我不明白为什么使用未排序的子集不会导致问题

关于如何解决这个问题的任何想法吗?

谢谢


问题答案:

文档非常好。如果您使用多索引,则需要多次阅读它们,这是值得的,请参见此处

In [9]: df = DataFrame(np.arange(9).reshape(-1,1),columns=['value'],index=pd.MultiIndex.from_product([[1,2,3],['a','b','c']],names=['one','two']))

In [10]: df
Out[10]: 
         value
one two       
1   a        0
    b        1
    c        2
2   a        3
    b        4
    c        5
3   a        6
    b        7
    c        8

In [11]: df.index.lexsort_depth
Out[11]: 2

In [12]: df.sortlevel(level=1)
Out[12]: 
         value
one two       
1   a        0
2   a        3
3   a        6
1   b        1
2   b        4
3   b        7
1   c        2
2   c        5
3   c        8

In [13]: df.sortlevel(level=1).index.lexsort_depth
Out[13]: 0

In [9]: df = DataFrame(np.arange(9).reshape(-1,1),columns=['value'],index=pd.MultiIndex.from_product([[1,2,3],['a','b','c']],names=['one','two']))

In [10]: df
Out[10]: 
         value
one two       
1   a        0
    b        1
    c        2
2   a        3
    b        4
    c        5
3   a        6
    b        7
    c        8

In [11]: df.index.lexsort_depth
Out[11]: 2

In [12]: df.sortlevel(level=1)
Out[12]: 
         value
one two       
1   a        0
2   a        3
3   a        6
1   b        1
2   b        4
3   b        7
1   c        2
2   c        5
3   c        8

In [13]: df.sortlevel(level=1).index.lexsort_depth
Out[13]: 0

更新

sortlevel将被弃用,所以在使用sort_index

df.sort_index(level=1)