Python替代方案,用于计算两组2d点之间的成对距离[重复]


问题内容

这个问题已经在这里有了答案

N点与参考之间的有效距离计算以numpy /
scipy为单位)
(6个答案)

两个不同的Numpy数组中的点之间的最小欧几里得距离,不在
(6个答案)之内

3年前关闭。

在Matlab中,存在pdist2命令。给定矩阵mx2和矩阵nx2,矩阵的每一行代表一个2d点。现在,我想创建一个mxn矩阵,使(i,j)元素代表从矩阵的第一个点到矩阵的i第一个点的距离。我只是简单地调用命令。mx2``j``nx2``pdist2(M,N)

我在python中寻找替代方法。我当然可以编写2个for循环,但是由于我正在使用2个numpy数组,因此使用for循环并非总是最佳选择。在python
Universe中是否有针对此的优化命令?基本上,我要用Python代替MATLAB的pdist2


问题答案:

您正在寻找cdist
scipy函数。它将计算两组n维矩阵之间的成对距离(默认为欧式)。

from scipy.spatial.distance import cdist
import numpy as np

X = np.arange(10).reshape(-1,2)
Y = np.arange(10).reshape(-1,2)

cdist(X, Y)
[[  0.           2.82842712   5.65685425   8.48528137  11.3137085 ]
 [  2.82842712   0.           2.82842712   5.65685425   8.48528137]
 [  5.65685425   2.82842712   0.           2.82842712   5.65685425]
 [  8.48528137   5.65685425   2.82842712   0.           2.82842712]
 [ 11.3137085    8.48528137   5.65685425   2.82842712   0.        ]]